De Vlaamse Waterweg a obtenu un permis pour des travaux d’aménagement des berges le long de la Lys, entre les écluses de Sint-Baafs-Vijve et de Harelbeke, en ce qui concerne leur impact sur l’environnement. Pour la réalisation effective des travaux, le permis est limité à la zone située entre l’écluse de Sint-Baafs-Vijve et le pont ‘Munkenbrug’ entre Ooigem et Desselgem.
Les travaux comprennent, si nécessaire, un élargissement et un approfondissement de la voie navigable afin de permettre une navigation plus fluide et plus efficace. La Lys est en effet une voie navigable principale au sein du réseau européen Seine-Escaut.
La reconstruction des berges est mûrement réfléchie. À divers endroits, des berges respectueuses de la nature seront aménagées, notamment en prévoyant des berges humides et marécageuses, combinées à des zones de repos pour la faune, des passes à poissons et des éléments atténuant les vagues. La végétation emportée par le fleuve devra être compensée.
La date de début des travaux sur le terrain n’est pas encore connue. La réalisation sur l’ensemble du trajet jusqu’à Harelbeke prendra plusieurs années. Des berges favorables à la nature ont déjà été aménagées à Deinze et à Zulte.